南雄市妇幼保健院前身为南雄县妇幼保健站，创建于1953年，1962 年建立南雄县妇幼保健所，1978 年更名为妇幼保健站。2001年晋升为一级甲等妇幼保健院;同年11月改名为南雄市妇幼保健院，编制9人，院址在南雄市水南路17号。医院占地面积 2200 平方米，建筑面积 4160 平方米。

南雄市妇幼保健院原有病床编制65张，2018年8月30日经南雄市卫生健康局批复，同意增加病床床位编制数35张，增加后的病床床位编制为100张。

经过近60年的发展，医院已成长为一所集保健、临床、预防、教学、科研为一体的一级甲等妇幼保健院，为江西省赣南医学院第一附属医院、东莞市妇幼保健院帮扶医院，本市医疗保险机构定点医院，现正在积极筹备创建二级甲等妇幼保健院。现有孕产保健部、妇女保健部、儿童保健部、检验科、药剂科、麻醉科、医学影像科等七个业务科室;办公室、人事股、财务股、医教股、护理部、行政股、健康教育科、公共卫生和信息股、设备科、医保办等十个行政职能股室。医院以实施“一法两纲”和“妇幼公共卫生”为核心，承担全市妇女、儿童保健、基层妇幼人员培训、计划生育指导及国家免费孕前优生健康检查、婚前医学检查、出生缺陷防控、地贫防控、预防艾滋病、梅毒和乙肝母婴传播等公共卫生服务及妇女、儿童的救治工作。

为给广大人民群众提供更高质量的医疗服务，医院不断加大设备投入力度，现已拥有三维彩色B超、微量元素检测仪、电子阴道镜、全自动生化仪、生物安全柜、DR、导乐分娩镇痛仪、钼钯、盆底康复治疗仪、安珂(EnCor)真空辅助全自动乳腺微创旋切活检系统等先进医疗设备。其中，检验科临床基因扩增实验室于2019年5月顺利通过广东省临床检验中心专家组审核验收，分子生物学技术水平步入同级医院行列，可开展感染性病原体基因项目和生殖遗传疾病相关基因项目，是我市新冠病毒核酸检测定点医院。