于都县中医院创建于1978年，是一所突出中医特色，中西医合璧，集医疗、保健、康复、教学、科研、基层中医指导为一体的国家“二级甲等中医院”，是国家级爱婴医院、北京市肛肠医院协作医院;属全国农村中医工作先进县龙头单位，赣州市“120”急救网络成员单位;是全县城镇职工医疗保险、城乡居民医疗保险、交通肇事医疗救治、计划生育技术服务定点医院。

医院占地面积9300㎡,医疗用房15320㎡，分为门诊大楼、住院大楼等建筑。拥有16排螺旋CT、四维彩超、腹腔镜、钬激光碎石和超声清石系统、DR、电子胃镜、电子肠镜、中医经络检测仪、肛肠综合治疗仪、乳腺钼靶、全自动生化分析仪、全自动血球仪、化学发光仪、动态心电图仪、中药煎药机、康复理疗等一大批先进诊疗设备。

医院人才荟萃，技术力量雄厚。现有职工408人，其中正高技术职称4人，副高技术职称23人，中级技术职称95人;第五批全国老中医药专家学术经验继承工作指导老师1人，江西省名中医2人，赣州市名中医1人，赣州市名医1人。设有17个职能科室，18个业务及临床科室。编制病床420张，分内一科(脾胃、肺病方向)、内二科(心、脑病方向)、重症医学科(ICU)、外科、骨伤科、针灸康复科、妇产科、急诊科、耳鼻咽喉科、儿科等10个病区。

医院坚持突出中医特色, 注重科技强院。针灸康复科为全国农村医疗机构针灸理疗康复特色专科，急诊科为省级重点中西医结合急诊科，针灸康复科及骨伤科为省级重点中医专科，妇产科、肛肠科、肺病科为省级基层特色专科。