伊犁州奎屯医院始建于1949年12月，是一所集医疗、科研、教学、预防保健、急救为一体的三级甲等综合医院。是新疆医科大学、石河子大学医学院、徐州医科大学教学医院，同时也是解放军总医院微波消融技术合作单位、新疆心血管病研究所奎屯分所、新疆包虫病定点治疗单位、中国中西医结合委员会烧伤专业委员会伊犁州烧伤治疗(培训)基地、自治区临床检验中心参比实验室单位、自治区住院医师规范化培训基地。

医院编制床位800张，占地面积10万㎡，建筑面积9.3万㎡。现有在职职工1032人，专业技术人员870人，其中高级职称211人，占24.4%，中级职称147人，占17.1%，初级职称505人，占58.5%。现有1.5T核磁共振、64排螺旋CT、C型臂数字减影等较为齐全的大型诊疗设备200余台件，设备资产达1.2亿元，固定资产3.1亿元。

医院开设临床科室29个，医技科室12个。骨科、心血管内科、儿科、消化内科、神经内科、普外科、感染内科7个科室为自治区级重点建设项目科室。医疗服务范围辐射伊犁州直、塔城、阿勒泰地区、博乐州各县市及兵团第五师、第七师、第九师各团场。伊犁州精神卫生诊疗中心、伊犁州脊柱创伤中心、伊犁州奎屯急救中心及奎屯市传染病医院、奎屯市康复中心、奎屯市精神残疾人托养中心设在我院，医院还承担着奎屯市3个社区卫生服务中心和9个社区卫生服务站的工作。