喀什市妇幼保健站是喀什市、乡(街办)、村三级妇幼保健网络综合服务的指中心，是以预防保健、医疗服务为一体的妇幼中心，担负着全市妇女儿童两个发展纲要各项指标的具体执行任务 ，同时要为全市广大妇女儿童提供妇女保健、更年期保健、孕期健康、产前胎儿缺陷筛查、高危孕产妇筛查、儿童保健、两系管理、新生儿听力筛查、新生儿疾病筛查、健康教育宣传、托幼机构保健管理、婚前医学检查及保健服务咨询、“乳腺癌、宫颈癌”筛查项目、叶酸增补项目、《出生医学证明》的发放与管理、计划生育手术与妇科常见病的诊治、艾滋病、乙肝、梅毒母婴传播阻断、流动人口健康管理、乡、街办(村、社区)以及各级助产医疗机构的妇幼专干人员培训、检查督导等综合服务任务。

设17个处室，分别是：儿童保健科、妇女保健科、青春期保健门诊、理疗科、检验科、计划生育手术室、注射室、B超室、产后康复室、宣教室、婚检室、药房、收费室、财务室、站长办公室、书记办公室、行政办公室。