山丹县中医医院始建于1982年，是一所集医疗、教学、保健、康复、科研为一体的二级甲等中医医院，为全县城乡居民、城镇职工医疗保险定点医院，是河西学院医学院、甘肃省卫生职业技术学院的教学医院，与153中心医院、甘肃省中医医院、兰州大学第一医院、兰州大学第二医院、甘肃省人民医院、甘肃省妇幼保健院等省内外知名医院建立了长期技术协作关系，并签约成立了“优势学科医联体”“医疗联盟”。医院现开放床位300张，职工267人，其中专业技术人员227人。设有党建办、办公室、医务科、护理部、财务科、药械科、公共卫生科、感染管理科、质控科、信息科、总务科等11个职能科室;内一科、内二科、内三科、外妇科、骨伤科、儿科、针灸推拿科、风湿疼痛科、康复医学科、老年病科、急诊科、门诊部、口腔科、治未病科等14个临床科室;放射科、功能科、检验科、药械科、体检科、手术室、消毒供应室、预检分诊等8个医技科室。拥有GE64排螺旋CT、GE-V8四维彩超、奥林巴斯电子胃肠镜、全自动生化分析仪、化学发光仪、血气分析仪等大、中型医疗设备及腰椎机械牵引床、熏蒸治疗仪、TDP治疗仪、颈椎牵引机等中医诊疗设备。

医院坚持突出中医特色的办院方向，建成省级重点专科2个(肺病专科、风湿疼痛专科)，市级重点专科1个(肝病专科)，开展中医诊疗项目60种，中医预防保健技术22项，制定25个常见病和优势病种中医诊疗方案，运用中西医结合方法治疗内、外、妇、儿、中医科等常见病和多发病，可开展胆囊摘除、胃切除、子宫全切除等各类常见手术(包括腔镜手术)，满足各类人群的体检需求。