西藏军区总医院是三级甲等医院。院址在西藏拉萨市娘热路。院长是兼任西藏军区副司令员的李素芝。西藏军区总医院前身是川东军区直属医院，1949年11月组建于重庆市长寿县。1952年3月搬迁到重庆市江北县洛碛镇。1953年更名西南区陆医院。1954年1月更名为西南军区洛碛二级陆军医院。同年又更名为西南军区第21医院。1955年1月，更名为陆军第49医院。同年奉命进藏。1962年2月1日，被命名为西藏军区总医院，并迁入现址。

医院占地面积约41万余平方米，建筑面积7万余平方米;编制床位 400张，现展开床位550张;编制干部、战士550人，现有645人;设有4部机关，14个行政科室，29个临床、医技科室，以及全军高山病防治研究中心、全军拉萨血站、成都军区创伤外科中心、西藏军区制剂中心、自治区医学重点实验室和中西医结合研究所;同时为第三军医大学拉萨临床医学院、西藏大学教学医院，是集医疗、科研、教学和保健为一体的“三甲”医院。

目前，医院拥有核磁共振、数字减影、CT、电镜、X光机、大型高压氧舱群、中心监护系统等价值4000余万元的医疗设备;建有全院微机联网管理系统、全军全国远程会诊系统以及青藏高原一家细胞培养室。