西藏自治区第二人民医院始建于1963年5月，前身是自治区一工人医院， 1988年9月10日正式更名为西藏自治区第二人民医院，1996年8月由罗布林卡南路整体搬迁到现在的院址(金珠中路119号)。50多年来经过一代代“二医院”人的砥砺奋进，从小到大、从无到有，医院已发展成为集医、教、研、预防、保健、康复、急救为一体的现代化三级乙等综合医院。

现院址占地面积为50927平方米，总建筑面积26958.7平方米，医疗用房面积12497.65平方米，精神卫生中心建筑面积4249.82平方米，周转房建筑面积5625.67平方米，经营性用房建筑面积2950.98平方米，其他用房1634.58平方米。

2019年全年共完成门急诊量93771次，同比增长45.4%;住院患者为5386人次，同比增长11%;出院患者5413人次，同比增加11.7%;开展各种临床手术1342台次，同比增长28.3%;实际开放床位数241张，床位使用率为79.1%，同比增加5.6%;床位周转次数22.5，同比增加30.8%;住院天数12.9天，同比减少-1.1%;愈率61.2%，同比增长2.0%;好转率33.4%，同比增长3%;死亡率0.5%，同比减少30%。医院总收入22,978万元，其中全年财政拨款12075万元，1—11月医疗收入10903万元。

全院核定编制职工数为324名，截止目前在岗职工为308名，其中在职专业技术人员280名，占全院人数的90%，主任医师6名，占全院人数的1.9%;副主任医师33名;中级职称人员89名，占全院人数的28.8%;初级以下人员191名，占全院人数的62%;行政后勤人员28名，占全院人数的9%。全院博士毕业生1名，硕士毕业生13名，在读硕士研究生1名;大学本科学历183名，大学专科学历83名,中专及高中以下27名。 

现医院有普外科、骨科、神经外科、神经内科、肾脏内科、心血管科、呼吸科、消化科、儿科、妇产科、急诊科、功能科、放射科、病理科、麻醉科、检验科、|“、剂科、五官科、高压氧科、康复科、皮肤科、口腔科、耳鼻喉、精神卫生中心共有21个临床医技科室;职能部门有党委办公室、院办公室、人事科、财务科、医教处、护理部、感控科、信息科、医保办、门诊部、医学装备及后勤保障中心(保卫科)病案质控统计科、招标采购办共有13个职能科室。

我院现属三级乙等综合医院，除承担拉萨市区部分职工、居民、流动人口以及各地区农牧民群众常见病、多发病防治工作外，还要承担各种应急任务、部分实习生和进修生的带教培训以及各种医疗保健、万名医师下乡和强基惠民等任务。2013年全区一所精神卫生中心挂靠我院，2016年4月试运行,承担着全区精神卫生的应急、诊疗、科普及培训、指导等业务工作,虽然现该中心机构性质未确定,人员编制为审批,我院采取措施全方位提升我区精神疾病医疗救治能力，2019年全年共接诊门诊患者9177人次，住院392人次，出院384人次，运营情况良好;2017年3月27日自治区包虫病医疗救治指导培训中心在我院成立,承担着全区包虫病综合防治定点医院医务人员培训和业务指导、推广包虫病新技术,提升包虫病外科手术治疗质量等工作任务。

我院的卫生受援工作始于1994年，由北京医院、北京中日友好医院对口支援我院，同时，四川大学华西医院重点帮扶我院;暨南大学附属医院友好帮扶我院。我院除全区唯一的精神卫生中心;自治区包虫病医疗救治指导培训中心外，还下设有新生儿出生缺陷筛查中心、 中国科学院“赵继宗院士西藏神经外科技术指导中心”中日友好脑瘫微创治疗中心、中日友好医院呼吸医联体、西藏康复医学学术委员会、北京天坛神经系统疾病专科联盟·成员单位。2017年与13家医疗单位签订医联体合作协议。