祥云县中医医院始建于1986年，院址几经变迁。岁月悠悠磨砺，银针草药薪火相传，经过30余年勤恳创业，医院顺利晋级为二级甲等中医综合性公立医院。是一所集医疗、教学、科研为一体的二级甲等中医院，是县域医共体中医药事业管理中心，是全县中医药工作的指导中心和中医药适宜技术推广中心。医院是云南中医药大学实习医院、昆明职业卫生学院、大理职业卫生学院、保山医专、德宏医专的实习基地。每年承担中专、大专、本科等各学历层次医学生的培养任务。

医院现有编制床位299张，职工293人，在编职工110人，其中卫生专业技术人员238人(正高级职称2人，副高级职称20人，中级职称37人)。含基层名老中医1人，白州名中医2人，云南省第四届好青年中医1人，祥云名医1人。

现设置一级临床科室11个、行政职能科室14个、开设中医专科门诊11个。其中针灸科为省级重点专科，骨伤科为州级重点专科;在建州级重点专科五个，分别是：肛肠科、皮肤科、推拿科、肺病科、老年病科。设置净化手术室4间(其中百级手术室1间，万级手术室3间)，主要开展骨伤、普外、妇科、泌尿、肛肠等手术。

医技科配置有CT、DR、彩色B超、全自动生化仪、电子胃肠镜、腹腔镜等高端诊疗设备。

医院先后荣获全国基层中医药工作先进单位、全国第二批中医预防保健服务试点地区医院、云南省县级先进中医医院、云南省中医药文化传承教育基地等荣誉称号，并于2020年10月27日顺利通过县级中医医院综合服务能力提升达标验收。

医院大力实施“人才兴院”战略,相继建立了四个专家工作站(上海中医药大学岳阳中西医结合医院沈国权专家工作站、云南省皮肤科名老中医刘复兴传承工作室二级工作站、全国基层名老中医姚春传传承工作室、程若川专家工作站)，着力培养了一批技术精、能力强的中医药人才储备队伍，拥有了一批德才兼备的学科带头人，塑造了一支医德高尚、服务好，具有高度凝聚力及战斗力的医疗技术团队。