牟定县中医医院于1988年在原共和镇医院基础上改建成立，2013年通过评审晋级为“二级甲等”中医医院，主要承担全县中医药事业发展和人民群众的疾病预防、保健、医疗和临床科研教学任务。2015年8月顺利实现医院整体搬迁，占地面积50亩，建筑面积12002㎡。2018年10月通过二级甲等中医医院复审，2021年10月通过云南省中医药综合服务能力提升达标验收工作。医院编制床位200张，实际开放床位300张。2021年10月通过补短板建设项目争取到专债投资9000万元，建设12层骨外科住院综合大楼一幢，建筑面积1753.54㎡，将于2024年初投入使用。

医院设有脾胃病科、老年病科、内二科、外科、骨伤科、针灸推拿科、康复科、急诊科、感染性疾病科、妇科、眼科、口腔科、皮肤科、麻醉科、治未病科15个临床科室;检验科、放射科、功能科、药剂科、消毒供应室5个医技科室。其中：有省级重点专科脾胃病科1个，州级重点专科针灸推拿科、骨伤科2个，骨伤科、老年病科为在建省级中医特色优势专科。有吴泽春省级基层名老中医药专家传承工作室1个，张成贞牟定名医工作室1个;与上海嘉定区中医医院、楚雄州中医医院签订对口帮扶协议;与云南省中医医院、昆明医科大学第二附属医院等4家省级医院建立了专科联盟;与昆明医科大学第二附属医院孙敏、许宁团队，云南大学附属医院、云南省第二人民医院、云南省眼科医院胡竹林教授团队，解放军联勤保障部队第九二〇医院徐永清教授团队，建立专家工作站3个。

医院人员编制75人，共有职工268人，其中：正式在编职工72人，编外职工196人;全院具有中、高级职称46人。卫生技术人员总人数213人，其中：医生71人，护理101人，医技、药剂人员32人、康复9人。

医院拥有128层螺旋CT、腹腔镜、钬激光、电子胃肠镜、G形臂、全自动生化分析仪、全自动凝血分析仪、全自动五分类血球分析仪、全自动尿沉渣分析仪、彩色B型超声诊断仪、眼底照相机等先进诊疗设备。配置了电脑恒温电蜡疗仪、医用结肠治疗仪、电脑骨创伤治疗仪、颈椎牵引器(椅)、全自动脉动加压冷敷机、肛肠坐浴器、中医定向透药-胃肠治疗仪、智能通络治疗仪等特色的中医诊疗设备。

医院开展针灸推拿、平衡火罐、中药熏洗、小针刀、毫火针、穴位埋线等70多项中彝医特色治疗及特色中医护理项目。开展肝、胆、胃肠、甲状腺、乳腺、妇科、肛肠、眼、口腔等疾病相关手术;开展针灸推拿、中医骨伤、中医内科、中医皮肤病、老年慢性病、治未病服务等特色治疗;外科开展微创腹腔镜胆囊摘除术、肾囊肿去顶术、前列腺电切术，微创手术治疗肾结石、输尿管结石、膀脱结石、甲状腺切除术;妇科开展微创子宫切除，输尿管切除术、子宫肌瘤剥除、卵巢囊肿剥除等手术;骨伤科运用手法整复正骨技术、外固定及中医骨伤三期辩证论治，开展创伤四肢骨折切开复位内固定术、闭合复位术，戴肢指(趾)术、骨瘤切除术、人工膝(髋)关节置换术、脊柱骨折经后路切开钉棒内固定术等多项手术;眼科开展白内障、青光眼翼状留肉眼球摘除等手术。

医院先后被州、县党委政府、工会、妇联等相关部门授予“先进单位”“先进基层党组织”“学习型党组织”“楚雄州学习型党组织建设示范点”省级“园林单位”“先进职工小家”“三八红旗集体” “州级文明单位”“州消防安全管理先进单位”及“牟定县脱贫攻坚先进集体”“牟定县工会工作先进集体”“牟定县民族团结进步先进集体”等荣誉称号。