云县中医医院成立于1998年，经过多年的发展，现已是一所集基本医疗、专科医疗、护理、康复、预防保健、公共卫生服务、应急救治、基层卫生人才培养为一体的二级甲等中医医院。

医院占地总面积53.87亩(35913.51M2)，建筑面积16745.38 M2，业务用房面积16131.24M2，编制床位170,开放床位245张，设有临床、医技科室19个(其中妇科、肛肠科为市级重点专科)，设张震国医大师工作室云县中医医院二级工作站，全国基层名老中医传承工作室1个。云南省中医医院专家驻我院对口帮扶，现有在职职工228人，其中卫生技术人员187人。有全国基层名老中医1人，云南省基层名中医2人，卫生专业技术高级职称23人，中级职称17人，现有执业(助理)医师58人(其中中医类别执业医师35人)，护士75人。医院充分发挥中医药特色优势，凸显中医特色，积极打造骨伤科、针灸科、推拿科、康复医学科、妇科、肛肠科等特色重点科室，成立了中医特色治疗专家组、特色产品研发小组，研发制作特色产品12类75种，开展中药熏洗、中药敷贴、膏方、针灸、推拿、中药足浴、中药热奄包、穴位按摩、刮痧、拔罐、火疗、冲击波、中频脉冲、中医透药治疗、火龙灸、手法通乳、肢体康复训练等中医医疗特色项目10类92项。

2013年，按照县级公立医院综合改革精神，以县医院为龙头、中医医院为枢纽、全县12个乡镇卫生院为基础的资源集团化医共体管理。通过实施一体化管理，乡(镇)村医疗卫生工作步入规范化、制度化和科学化的管理服务模式。乡镇卫生院及卫生室技术水平得到提高，医疗质量得到提升，群众负担得到减轻，中医药业务得到发展，分级诊疗工作得到落实，村卫生室建设及乡村医生服务能力得到提升，为全县卫生事业可持续发展打下坚实基础。