骨髓增生异常综合征（MDS）的病因尚未完全清楚，可能与多种因素有关，包括遗传突变、环境暴露和免疫异常等，导致造血干细胞在骨髓内发生异常增殖和分化，最终导致血液细胞产生障碍和功能异常。

1.遗传因素：一些人可能携带具有MDS倾向的基因突变。这些突变可能来自家族遗传或在生命过程中产生。如TP53、SF3B1、DNMT3A等基因异常与MDS的发生相关。

2.染色体异常：MDS患者的染色体异常很常见。这些异常导致造血细胞的功能和成熟受损。丧失或异常的染色体结构可能会导致某些基因的表达改变，进而影响细胞的生长和发育。

3.环境暴露：长期暴露于某些致癌物质和有害物质，如化学物质、辐射和某些药物，可能导致MDS发展。这些物质可能会损害造血细胞的DNA，增加发生基因突变的风险。

4.免疫功能紊乱：免疫系统在调节造血过程中发挥重要作用。免疫功能紊乱会干扰造血过程，从而导致MDS的发生。自身免疫性疾病、免疫抑制治疗等可能导致免疫功能紊乱。